Установа організована в 1975 році за ініціативою професора Авілової О.М. на базі дитячої клінічної лікарні №7 Печерського району як міський пульмонологічний центр. Було відкрито два хірургічних відділення для дорослих і дітей.  22 червня 1975 року лікарня прийняла першого хворого. В завдання відділень входило надання планової хірургічної допомоги при захворюваннях органів грудної клітки.
    Досвід хірургічної роботи і вивчення стану надання медичної допомоги хворим м. Києва з тяжкими травмами дали змогу вперше, в колишньому СРСР, у м. Києві створити спеціалізоване відділення для прийому пацієнтів з важкими комбінованими травмами грудної клітки.
З березня 1976 року до 1986 року, тобто до відкриття лікарні швидкої і невідкладної медичної допомоги всі постраждалі з політравмою в м. Києві доставлялися у відділення, що тоді мало назву “травма грудної клітки”.
    Перебування пацієнтів з травмою разом з хворими, які поступали для планового оперативного та консервативного лікування, виявилося несумісним. Тому в 1982 року в окремому корпусі було розміщено два відділення (по 60 ліжок): торакальної хірургії для дорослих і клінічна пульмонологія.
    З 1988 року відкрито лабораторно-адміністративний корпус, де розмістилися клінічна, бактеріологічна, патогістологічна, цитологічна лабораторії, центральне стерилізаційне і консультативно-діагностичне відділення.
    Таким чином, було завершено формування повноцінної структури центру, який виконує функції міського консультативного, діагностичного, лікувального, навчально-методичного закладу з торакальної хірургії та пульмонології. Навчально-методична робота забезпечується спільно кафедрою торакальної хірургії та пульмонології НМАПО
ім. П.Л. Щупика.